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对中国武汉一个市场的基因数据进行的一项新研究表明，该数据不支持大流行始于非法交易动物的情况，引发了关于样本的新辩论，其他科学家认为这些样本是如何解决这一难题的关键部分。冠状病毒传染给了人类。
这项新研究检查了 2020 年初从市场表面采集的拭子中动物和病毒物质的相对数量，并表示很难得出结论，即给定的病毒样本是来自受感染的活体动物，还是仅仅是来自偶然的污染。
但一些外部专家表示，该研究的作者、弗雷德哈钦森癌症中心的病毒学家杰西布鲁姆本周在网上发布的分析可能受到了一些未知变量和有关如何过滤数据的决定的影响。
由于这些原因，他们说，这些发现并没有太大影响他们对以前研究的印象。 他们说，来自市场的样本含有动物和病毒遗传物质，这与那里的一只动物——可能是一只浣熊——将病毒传播给人类的可能性相符，但并不能证明这种情况已经发生。
宾夕法尼亚大学微生物学家 Frederic Bushman 说：“我认为他们捡到一只受感染的浣熊的可能性相当大，但这并不能证明那是起源地。”市场，但没有参与任何市场研究。 “我认为 Bloom 论文并没有太大改变我的想法。”
中国研究人员去年写下了市场数据，然后在今年提供了基因序列，让国际科学家团队对其进行研究。 该团队在上个月的一份报告中写道，根据这些数据，他们无法最终确定将病毒传播给人类的动物。
但他们表示，数据证实，2019 年底，市场上出售了被认为易感染该病毒的动物，例如浣熊和果子狸（一种与 20 年前 SARS 爆发有关的小型亚洲哺乳动物）。最早的 Covid-19 患者也在市场上工作或购物。
据报道，该市场是武汉仅有的四个出售可能传播病毒的活体动物的地方之一，因此科学家们表示，如此多的早期患者不太可能纯粹是偶然与该市场有关。 他们说，基因数据还建立在其他证据的基础上，包括该病毒的两个早期谱系已经上市。
本周的研究采用了不同的方法来分析基因序列。
布卢姆博士研究了病毒遗传物质的数量是否与样本中易感动物物种的遗传物质数量相关。 他在接受采访时说，如果市场上的一个物种对传播病毒负有压倒性责任，他本希望看到病毒遗传物质的数量与该物种的遗传物质数量之间存在明显联系。
但该研究没有发现这种明显的相关性。 相反，最强的相关性涉及市场上出售的各种不可能被感染的鱼，这表明受感染的人可能在鱼所在的地方沉积了病毒物质。
布卢姆博士说，这一发现表明，到 2020 年初收集拭子时，这种也称为 SARS-CoV-2 的病毒已在市场上广泛传播。
“以同样的方式，我们不应该过多地了解有一堆 SARS-CoV-2 与大口黑鲈和鲶鱼样本混合的事实，我们也不应该过多地了解有浣熊狗样本的事实带有 SARS-CoV-2 读数，”Bloom 博士说。
但外部专家表示，样本的各种特征可能会影响将动物和病毒材料联系起来的努力。 国际科学家在他们的报告中表示，他们曾考虑进行类似的分析，但它有产生误导性结果的风险。 布卢姆博士承认，“这是一个悬而未决的问题，即这是否是一个值得计算的信息量。”
威尔康奈尔医学院环境采样专家克里斯托弗梅森说，病毒的遗传物质会迅速降解。 至关重要的是，病毒材料的腐烂速度可能与动物材料不同，因此很难在市场关闭后数周内收集的样本中对它们进行比较。
比利时鲁汶大学的进化生物学家 Tom Wenseleers 说，鱼与病毒的关系最密切可能仅仅是因为鱼很可能被冷冻或冷藏，从而减缓了这些样本中病毒物质的衰变。
Wenseleers 博士说，最新的分析“证实，观察这些类型的相关性几乎无法告诉你哪些宿主物种可能是大流行病的可能来源”。 他说，这让科学家处于与以前相同的境地，市场数据并未提供任何特定起源情景的确凿证据。
这项新研究还仔细观察了市场推车上的拭子，国际团队在市场上发现了一丝病毒和浣熊的遗传特征，但没有检测到人类的遗传物质。
布卢姆博士写道，拭子只有极少量的病毒物质，尚不清楚为什么中国研究人员将拭子归类为 Covid 阳性。 他的研究表明，拭子是唯一一种含有大量浣熊遗传物质且带有任何病毒痕迹的拭子。
不过，一些科学家表示，布卢姆博士的分析可能会因为对样本中动物遗传物质的数量设定过高的标准而驳回其他 Covid 阳性拭子。
宾夕法尼亚大学的布什曼博士说，分析中使用的阈值是“激进的”，最好是比较从一系列不同的截止点获得的结果。
使用更敏感的阈值，国际科学家团队确定了多个含有浣熊遗传物质的 Covid 阳性样本，以及其他具有被认为易感染该病毒的不同动物的遗传特征的样本。
前约翰霍普金斯大学的计算生物学家亚历山大·克里茨-克里斯托夫帮助领导了国际团队的分析，他说，该团队还仔细研究了中国研究人员将购物车上的拭子描述为病毒阳性是否正确。
他指出，同一摊位的其他一些拭子对该病毒呈明显阳性。 他说，市场其他地方的采样结果也表明，与购物车上的拭子不同，大多数真正阴性的拭子根本没有病毒痕迹。
“这是一种病毒的环境采样，就像大海捞针一样，”克里茨-克里斯托夫博士说。
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